在分析大氣污染防治工作存在的問題時，周生賢認為隨著國民經濟的持續快速發展，能源消費的不斷攀升，發達國家歷經近百年出現的環境問題在我國近二三十年集中出現，呈現區域性和復合型特征，存在發生大氣嚴重污染事件的隱憂，大氣環境形勢非常嚴峻。

　　周生賢說，以煤為主的能源結構導致大氣污染物排放總量居高不下。我國長三角、珠三角和京津冀三大城市群大氣污染物排放集中，區域性大氣污染問題日趨明顯；大中城市空氣污染開始呈現煤煙型和汽車尾氣復合型污染的特點，大氣污染治理的難度加劇；環境法規和保障體系有待進一步加強。

　　針對這些問題，周生賢提出，下一步我們將繼續著力解決危害群眾健康的突出大氣環境問題。

　　——確保實現主要大氣污染物減排目標。把強化政府責任作為實現減排目標的關鍵環節，切實落實《節能減排綜合性工作方案》。著力推進結構減排，堅決遏制高耗能、高排放行業過快增長，2009年將分別淘汰電力、煉鐵、煉鋼、造紙等行業落后生產能力1500萬千瓦、1000萬噸、600萬噸和50萬噸；繼續做好工程減排，2009年將新增燃煤電廠脫硫裝機容量5000萬千瓦以上，新建20臺(套)鋼鐵企業燒結機煙氣脫硫工程；大力推進監管減排，將脫硫設施穩定運行作為監管重點。

　　——建立和完善區域、城市大氣聯防聯控機制。研究建立區域大氣污染聯防聯控工作機制；組織開展全國大氣污染重點區域劃分工作，編制珠三角、長三角和京津冀區域大氣污染防治規劃，明確目標，建立目標責任考核制度。

　　——進一步加大產業結構調整力度。嚴格環境準入，確保國家拉動內需投資的環境安全；加大煉鋼、煉鐵、鐵合金、焦炭等13個行業落后生產能力的淘汰力度，嚴格控制“兩高一資”項目和產能過剩行業的過快增長。

　　——大力推進機動車污染防治工作。力爭到2020年，新車排放控制水平與發達國家接軌；確保新車出廠穩定達標；實施全國統一的在用車環保標志管理制度；鼓勵使用車用燃油清凈劑，改善車用燃油品質；大力發展壓縮天然氣、液化天然氣、生物柴油、燃料電池和混合動力等清潔能源車輛。