目前，原料藥行業正在進行產業結構調整、轉型升級，新版GMP認證已經通過提升質量標準淘汰了部分產能。而且相當多的企業尤其是大型企業都意識到了環保的重要性，每年均有環保投入。一些原料藥企業甚至用自覺限產的方式達到環保要求。

　　盡管如此，制藥環保前進步伐似乎又很難跟上社會要求的節奏。已故制藥工業專家俞觀文老先生曾痛心地表示：制藥行業環保欠賬太多，投入太大。

　　據環保部門統計，2013年國控重點污染源四項主要污染物監督性監測運行經費總額為3.54億元，2014年預計會繼續加大相關的污染物監測預算。

　　之所以對制藥板塊環保法規的標準與細則如此復雜，是因為在各個工業門類中，制藥行業是化學需氧量、氨氮排放量大的重點行業之一。生產一種原料藥往往有幾步甚至十余步反應，使用原材料數種，有的甚至高達三四十種;原料總耗有的達到10kg/kg產品以上，高的超過200kg/kg產品。

　　據了解，石藥集團在環保投入已超5億，共推出386項清潔生產方案、196項節能項目，年節電4千萬度，減少COD排放量2千余噸。聯邦制藥用于環保的投入已達到3億多元，目前已擁有包括設備綜控系統、CASS(生物耗氧)池、氨氮處理系統等在內的完善的環保處理系統。

　　今天的制藥環保問題應該上升到行業戰略高度。隨著制藥生產標準提高，更多的產品走出國門，未來環保也將成為淘汰落后產能，產業升級的重要推手。