國家級開發區“十二五”發展總體目標是：地區生產總值年均增長15%，2015年末達到53000億元。國家級開發區實際利用外資年均增長9%，達到480億美元;稅收收入年均增長18%，達到10600億元;服務業增加值占生產總值比重達到30%;高新技術企業產值占工業總產值比重達到49%。

　　而邊境合作區“十二五”發展總體目標是：地區生產總值年均增長20%，2015年末達到980億元;實際利用外資年均增長14%，達到8億美元;稅收收入年均增長17%，達到90億元。《規劃》同時對不同的國家級開發區提出了分類目標。比如，東部沿海地區的國家級開發區要率先轉變經濟發展方式，堅持高端發展的戰略取向，進一步提高對外開放水平，著力提升科技創新能力，著力發展戰略性新興產業，打造若干規模和水平居世界前列的先進制造業基地，建設一批主體功能突出、輻射帶動能力強的現代服務業集聚區。

　　對西部地區的國家級開發區，《規劃》要求，發揮當地資源和特色產業優勢，加強與東部、中部地區產業合作，進一步做大做強優勢產業，發展壯大一批規模和水平居全國前列的產業集群，堅持科技創新和綠色發展，大力發展外向型經濟，在實施西部大開發和沿邊開發開放戰略中發揮示范引領作用。